課程資訊
課程名稱
專題研究
Undergraduate Research in Life Science 
開課學期
104-1 
授課對象
生命科學系  
授課教師
丁照棣 
課號
LS3900 
課程識別碼
B01 49100 
班次
13 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
 
上課地點
 
備註
F群選擇必修。選課前請先徵求授課教師同意。
限學士班二年級以上
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1041SciResearch 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

針對大學部二年級以上對遺傳、基因體、演化有興趣的同學設計專題,專題主軸將從基因註釋 (gene annotation) 作為開端,參與的同學將利用所學遺傳與分資生物學知識參與果蠅基因註釋計畫。每位同學在選課後即成為Genome Education Partnership (GEP, http://gep.wustl.edu) 的學生成員,將與數十所大學共同參與果蠅點狀染色體基因注釋計畫(Drosophila dot chromosome project, http://gep.wustl.edu/projects/dot_chromosome),每位同學將負責一段 40 Kb 區段的基因注釋,在分析過程中將瞭解實際基因注釋所需的知識與目前註釋程式的限制,同學在完成注釋後需繳交完整的報告並將有機會與 GEP 成員共同發表科學論文(http://gep.wustl.edu/community/publications)。修課學生與教師於每週定期討論,在討論的過程中授課教師將與學生將針對彼此有興趣的課題,交換意見。課程將注重科學研究方法 (Scientific Skills) 的訓練,為初次修習專題研究的同學奠定未來進入科學研究的基礎。 

課程目標
教師也將協助大學部學生發掘研究興趣,在教師指導下針對遺傳、演化的特定主題進行研究。 
課程要求
General Biology and Genetics 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目
[Science as a career]
On being a scientist (http://www.nap.edu/readingroom/books/obas/)
Advice for a young investigator – by Santiago RamonyCajal
Who wants to be a scientist? – by Nancy Rothwell
At the bench: A laboratory navigator – by Kathy Barker (Chapter 1, 4, 5)

[Books about flies]
Lords of the fly: Drosophila genetics and the experimental life – by Robert E. Kohler
A history of genetics – by A. H. Sturtevant
Time, love, memory : A great biologist and his quest for the origins of behavior – by Jonathan Weiner
Fly: The unsung hero of twentieth century science – by Martin Brookes 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
Week 3
  Introduction 
Week 4
10/13  NCBI online lectures (https://www.youtube.com/watch?v=mvjHYMgJDTQ&list=PLH-TjWpFfWrtjzMCIvUe-YbrlIeFQlKMq&index=4)/ NCBI homework 
Week 5
10/22  Genome Project online lecture (https://www.youtube.com/playlist?list=PLF0701633C91835BF)/ NGS (https://www.youtube.com/playlist?list=PLXmLGkIgh1kVrMqPqMIih4sW6fyKY0kHy)/ Simple Annotation Project 
Week 6
  Annotation Project 
Week 7
  Annotation Project 
Week 8
  Annotation Project 
Week 9
  Gene expression profiling/SNP profiling 
Week 10
  Gene expression profiling/ SNP profiling 
Week 11
  Gene expression profiling/SNP profiling 
Week 12
  Gene expression profiling/SNP profiling 
Week 13
  Gene expression profiling/SNP profiling 
Week 14
  Gene expression profiling/SNP profiling 
Week 15
  Gene expression profiling/SNP profiling 
Week 16
  Gene expression profiling/SNP profiling 
Week 17
  Gene expression profiling/SNP profiling